Після закінчення приватного ліцею з поглибленим вивченням іноземних мов майбутня зірка надійшла одразу на другий курс Інституту готельного менеджменту та туризму. Закінчивши вуз, Бородіна здобула спеціальність менеджера з туризму.
Дочки телеведучої Ксенії Бородіною Марія та Теона ходять до гімназії імені Євгена Примакова. Ця школа — одна з «зіркових»: її відвідує дочка ведучої Юлії Баранівської Яна, молодша дочка гумориста Михайла Галустяна, діти його колеги Гаріка Мартіросяна, актриси Ганни Банщикової та багатьох інших артистів.
Є вірменкою по батькові, російською по матері. Батько – Кім Джимович Амоєв (3 березня 1940 – 18 травня 2018), мати – Інна Булатівна Бородіна (Р. 8 листопада 1960). Коли Ксенії був один рік, батьки розлучилися.